Rechner wird ständig langsamer

Hallo,
ich fürchte ich brauche dringend etwas fachmännische Hilfe.

Board: Asus P8Z77 -V LX
Prozessor: Intel Core i7 3770k
Arbeitsspeicher: 32Gb DDR3
Grafik: GeForce GTX680 2Gb
Festplatten: Laufwerk 0 2Tb HDD von Seagate
             Laufwerk 1 240Gb SSD OCZ-Agility3

Mein Rechner startet im Moment regelmäßig nur sehr langsam, bzw Fehlerhaft. Das Problem trat zum ersten Mal vor ca. 2 Monaten auf. Der Rechner fährt Ordnungsgemäß hoch, aber sobald er dann auf dem Desktop ist wird plötzlich alles extrem langsam. Die Internetverbindung wird nur langsam initialisiert, Programme lassen sich überhaupt nicht öffnen und auf Tastaturbefehle wird nicht reagiert (alt+strg+ent;alt+shift+esc bringen keine Reaktion) das geht dann ungefähr 2-3 Minuten so und danach lief er einigermaßen normal. Das merkwürdige daran war, dass der Rechner nach dem drücken des Resetknopfes vernüftig hochfahren konnte und alles glatt lief. Jedenfalls bis diese Option gestern dann auch ausfiel und ich mich entschieden habe das System neu aufzusetzen...

Nach dem Neuaufspielen des Systems lief der Rechner so flüssig und schnell wie am ersten Tag, nach der Installation der Windows Updates bestand allerdings wieder das selbe Problem...

Also habe ich noch einmal den Rechner neu aufesetzt...

Dieses mal habe ich nicht mit den Windows Updates begonnen, sondern andere Treiber installiert (Chipset, Maus, Tastatur, Sound etc.) beim letzten Treiber dann plötzlich nach dem neustart wieder dieser extrem langsame Start.

Danach habe ich eine Systemwiederherstellung zum Zeitpunkt vor dem ersten Treiber gemacht und die Windows Updates erneut laden und installieren lassen.
Dieses mal bestand nach dem neustart kein Problem, alles lief flüssig. Danach habe ich die Treiber für die peripheriegeräte installiert und es lief immernoch alles flüssig. Das Problem trat dann wieder auf, nachdem ich die Treiber für die fehlerhaften Geräte im Geräte-Manager installiert habe.

Wieder sitze ich vor dem Problem dass der Start extrem verlangsamt ist.

Ich hab jetzt schon ne Menge recherchiert und rumprobiert und gestern ingesamt über 12h damit verbracht ne Lösung dafür zu finden, aber ich bin mit meinem Latein inzwischen völlig am Ende.
Ich kann nich sagen, ob das Problem Software oder Hardwaregebunden is oder höhere Gewalt dahintersteckt und ich hab auch keine Lust ständig Wiederhestellungspunkte zu setzen und zu hoffen, dass das nächste installierte Programm mir nich wieder den rechner zerlegt...

Anmerkung:
- Beim neuaufspielen des Systems habe ich immer nur die SSD festplatte formatiert und beschrieben. Auf der HDD sind Spiele und andere Dateien drauf, auf die ich zur zeit allerdings nicht weiter zugreife
- Im abgesicherten Modus, auch dem mit Netzwerktreibern, läuft der Computer immer gewohnt schnell und absolut Problemlos
- Der Fehler scheint nicht bei einer bestimmten Installation aufzutreten. Ich hab verschiedene Male rumprobiert und das Programm, dass den Fehler verursacht hat war scheinbar nie das selbe

Wennn noch irgendetwas an Informationen gebraucht wird(ereignislogs, rechnerinfos oder ähnliches) einfach bescheid sagen, ich versuch alle nötigen Infos ranzukriegen.
 
Ich hoffe es gibt hier jemanden der mir helfen kann. Der Computer selbst ist echt super, aber das Problem zerrt an meinen Nerven.

MfG Nils