Wieso funktioniert der Explorer nicht mehr ordnungsgemäß?

ich hab das gleiche Problem seit ca. Oktober 2005
Damals hatte meine Festplatte den Geist aufgegeben also hab ich mir eine neue eingebaut und das system 1:1 rüberkopiert. Einige Programme musste ich zwar neu installieren, aber das war nicht so tragisch.
Tragisch war und ist immer noch, daß der Explorer unmittelbar nach dem booten sich weghängt. Ich weiss daß man das mit einer XP-Neuinstallation lösen kann. Aber da der Rechner auch geschäftlich genutzt wird, Webserver, FTP-Server, Datenbankserver und Gameserver darauf laufen und ich wahrscheinlich Monate brauchen werde um das alles wieder zum laufen zu kriegen, hab ich mich vorerst damit abgefunden.Ich hab mir nen Freeware- Dateimanager installiert und kann eigentlich ganz normal mit dem system arbeiten.Die Server laufen 1a, ich kann damit programmieren und spielen, windowsinterne Sachen kann ich zur Not über die .cpl- Dateien aufrufen etc. etc. etc.
Es wär aber dennoch schön wenn jemand ne Idee hätte wie man den Explorer reparieren kann.
P.S. Es ist garantiert kein Virus oder Spyware vorhanden. ich hab unzählige Scans durchgeführt und die Registry auch aufgeräumt. Ich vermute mal das eine der Dateien die der Explorer braucht in einem defekten Bereich der alten Festplatte lag und auch so übertragen wurde, nur finde ich einfach nicht raus welche.