allway sync

"Harddiskkopien meines Laptops" - sollen das Images vom Laufwerk mit Betriebssystem sein oder Kopien der Datenpartitionen?
Für Datenkopien wäre diese Synchronisiererei verständlich und evtl. notwendig / sind es Images des installierten Betriebssystemes und der Programme - dann ist solche Synchronisiererei "blankes Gift" (zerstören jedes Image).

Was bei dem von Dir "Hin- und Her-Synchronisieren" bezeichneten Prozeß läuft weiß kein Fremder. Du selbst kannst keine zusätzlichen Angaben machen, da die Aktion vermutlich unbeobachtet ablaufen sollte.
Fazit: zu diesem Vorgang wird wohl kaum eine vernünftige Aussage eines Fremden zu erwarten sein.

Zum Zustand der externen Festplatte ist vielleicht eine Aussage möglich, wenn Du ein Bild der Datenträgerverwaltung mit dargestelleter externer Festplatte hier anhängst oder verlinkst.
Erste Überlegung - Deine Synchronisiermanöver haben das Dateisystem der externen Platte verändert. - Wie die Veränderung aussieht... vielleicht nach Einsicht in Datenträgerverwaltung zu beurteilen. Danach wäre evtl. auch ein Rat möglich wie an die Datenrettung heranzugehen ist.

Zu "Allway Sync" - hast Du solche Version genutzt wie sie bei chip.de downloadbar ist? - Lies bitte mal dort die Beschränkungen zu der Freeware!
. http://www.chip.de/downloads/Allway-Sync_21840421.html
(Ist aber nur ein "Parallelproblem" zu der nicht mehr lesbaren Festplatte.)