Externe Festplatten

Ich trenne dann die Festplatten vom Laptop
und die Festplatten erscheinen dann in einem eigenen Fenster.

Dazu solltest du etwas genauer schreiben was du unter "eigenem Fenster verstehst. - Ein weiteres Fenster des Dateimanagers (des Windows-Explorer)?

Wird denn ein vorher geöffnetes Fenster bei dir nicht aktualisiert, wenn du im Navigationsbereich des Explorer das Verzeichnis "Computer" markierst und diese Ebene im rechten Fenster aufrufst?
(Bild hier zeigen wäre anschaulicher)

Das Verfahren zum Abmelden der externen Festplatten über den Hardwaremonitor "Hardware sicher entfernen" benutzt du - oder entfernst du einfach den USB-Stecker aus der Buchse?

Vorschlag: den USB-Inf-Cache mal leeren mit "USBDeView"
(Alle im Fenster des Tools aufgelisteten Geräte mal deinstallieren - es werden da auch noch Geräte aufgelistet, die schon Ewigkeiten nicht mehr mit dem Rechner verbunden waren.
Download Tool und Sprachenpatch DE von:
http://www.nirsoft.net/utils/usb_devices_view.html
Beide Archive in ein gemeinsames Verzeichnis entpacken, vom Speicherort aus starten - keine Installation erforderlich.

Nach Neustart des Rechner werden die noch im System vorhandenen Treiber mit den Ports verbunden, an den Geräte gekoppelt sind / später gekoppelt werden.

Ist im Anschluß das Erkennen und Anzeigen der externen Datenträger wieder normal (wie in zurückliegender Zeit)?