Da die Datei inhaltsleer ist und somit absolut harmlos, kann man machen, was man will. Die Msdos.sys enthält seit 1995 keinen Programmcode mehr. Vor XP standen noch paar Konfigurationseinträge als DOS-Text drin, jetzt gar nichts mehr. Das File ist auch nicht als Programm startbar.
In einen Wiederherstellungspunkt gelangt das File beim Löschen wahrscheinlich nicht und wenn doch, wärs egal.
Das Spielchen mit Wiederherstellung aus, dann wieder an kann man zum Zeitvertreib hierbei machen, nur sind dann die alten Wh.punkte fort.
Da das File nirgendwo anders als in c:\ gehört, ist das zweckmäßigste, es endgültig mit Shift-Entf zu löschen (die Warnmeldung übergehen). XP wird es nach ein paar Bootvorgängen selbständig wieder in c:\ anlegen - wieder mit Null Byte. Und dann sollte man das File für immer vergessen.