Ich denke bei diesem Problem an mehrere Dinge und es ergibt sich daraus die Frage, warum willst du das so einrichten?
Problem 1: Der Anwender hat die Autostartfunktion für CD's auf seinem Rechner deaktiviert.
Problem 2: Der Anwender hat die Ausführung aktiver Inhalte auf seinem Rechner deaktiviert.
Problem 3: Der Anwender ist sicherheitsbewußt und sieht es gar nicht gerne, dass einfach so Programme auf seinem Rechner installiert werden. Du machst dir mit deiner CD keine Freunde. 
Problem 4: Die Installation des Programms benötigt Administratorrechte. Der Anwender arbeitet (aus Sicherheitsgründen) aber mit einem eingeschränkten Konto.
Problem 5: Der Anwender installiert seine Programme i.d.R. nicht in den dafür vorgesehenen Standardverzeichnissen. Um das Vorhandensein eines bestimmten Programms zu ermitteln, müssten alle vorhandenen Pfade, respektive alle in Frage kommenden Registryeinträge durchsucht werden.
Wenn das benötigte Programm auf dem Rechner des Anwenders installiert ist oder überhaupt irgendein Programm, das mit den Dateien deiner CD zurecht kommt, dann gibt es mit hoher Wahrscheinlichkeit auch entsprechende Verknüpfungen, so dass diese Anwendung startet, wenn der User deine Dateien anschauen möchte.
Warum erstellst du keine Readme in der du alles erklärst und legst eine Verknüpfung dazu im Startmenü der CD ab? Dann kann jeder selbst entscheiden, ob er eine EXE-Datei von der CD ausführen möchte oder nicht. Oder, ob er lieber erst mal einen Virenscann machen möchte ...
